سامانه مدیریت نشریات علمی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار

حاجیا, مسعود. (1398). جایگاه روشهای مولکولار اپیدمیولوژی در عفونتهای روده ای از یک نگاه دیگر. مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26(3), 311-318.
مسعود حاجیا. "جایگاه روشهای مولکولار اپیدمیولوژی در عفونتهای روده ای از یک نگاه دیگر". مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26, 3, 1398, 311-318.
حاجیا, مسعود. (1398). 'جایگاه روشهای مولکولار اپیدمیولوژی در عفونتهای روده ای از یک نگاه دیگر', مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26(3), pp. 311-318.
حاجیا, مسعود. جایگاه روشهای مولکولار اپیدمیولوژی در عفونتهای روده ای از یک نگاه دیگر. مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 1398; 26(3): 311-318.

جایگاه روشهای مولکولار اپیدمیولوژی در عفونتهای روده ای از یک نگاه دیگر

مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار
مقاله 5، دوره 26، شماره 3، مرداد و شهریور 1398، صفحه 311-318    اصل مقاله (1010.85 K)
نوع مقاله: مروری
نویسنده
مسعود حاجیا*
مسئول بخش بیولوژی ملکولی آزمایشگاه مرجع سلامت وزارت بهداشت و درمان و آموزش پزشکی
تاریخ دریافت: 07 مهر 1397،  تاریخ بازنگری: 28 مهر 1397،  تاریخ پذیرش: 18 دی 1397 
چکیده
امروزه روشهای تایپینگ ملکولی نقش اساسی در بسیاری از معضلات حوزه پزشکی ایفا می نمایند. این تکنیکها که هر روزه با معرفی روشهای جدید سبب افزایش دقت نتایج حاصله خود شده اند. همچنین توانسته اند ما را به فهم بهتری در تحلیل وضع موجود قادر نموده، در معظلات سیستم بهداشتی راهنمایی نمایند تا با اتخاذ اقدامات پیشگیرانه از وقوع همه گیری های بعدی جلوگیری شود.هدف این روشها پی بردن به منشا کانون انتشار با مطالعه عوامل عفونی شناسایی شده میباشد هدف این روشهای با مطالعه ارتباط عفونت ایزوله شده و مقایسه نتایج به منشاء کلونیزه هست. همچنین کمک به تمایز آلودگی های محیطی از گونه های عفونی زا نموده و ردیابی عفونتهای بیمارستانی از منشا انتشار میباشد. هم اکنون این روشها در مراکز و سیستم های بهداشتی و بیمارستانی بکار گرفته شده اند و توانسته اند سهم بسزایی در کاهش هزینه های درمانی ایفا نمایند. یکی از این روشها روش پالس فیلد ژل الکتروفورز هست. استقرار این سیستم با توجه به ویژگی های فنی آن در کل کشور جهت دست یابی به اهداف فوق نیازمند بودجه سنگینی هست تا با تشکیل یک شبکه کشوری تمامی رخداد ها قابل ثبت و پیگیری باشند. انجام این مهم بدون حمایت سازمان مسئول در سیستم بهداشتی و مراکز تحقیقاتی بر نمی آید.
در این مقاله سعی شده تا با بررسی ویژگی ها و محدودیت های روش پالس فیلد ژل الکتروفورز، و بررسی توانمندی موجود در کشور توانمندی موجود کشور آشنا شده و نیز مدلی کاربردی ارائه شود که کمک کننده سیستم بهداشتی دراعلام هشدارهای لازم باشد. امید است تا با نظرات اصلاحی صاحب نظران عزیز بتوان سیستم مناسب جهت تحقق این هدف دست یافت.
کلیدواژه‌ها
مولکولار اپیدمیواوژی؛ عفونتهای روده ای؛ سیستم بهداشتی
موضوعات
آمار و اپیدمیولوژی
عنوان مقاله [English]
The situation of molecular epidemiology in enteric pathogens in Iran from another perspective
نویسندگان [English]
Massoud Hajia
Head of Devision, Health Reference Laboratory, Ministry of Kealth and Higher Education
چکیده [English]
Today, molecular typing methods play an essential role in many medical issues. These techniques, which are introduced every day by introducing new methods, increase the accuracy of their results. They have also enabled us to better understanding the status quo, advice on health system problematic subjects, and avoid further preventive measures from occurring. Molecular typing methods allow researchers to study the association between isolated pathogens and compare the results to their colonized origin. It also helps to differentiate and detect environmental contaminations from infectious species, identify and track hospital infections from its source. Nowadays, these methods have been used in many countries in health centers and hospitals. These tests have been able to play a significant role in controlling the spread of infection and reducing health costs. One of these tests is Pulse Field Jel Electrophoresis (PFGE) that plays an important role in water- and food-borne disease. Set of the whole system requires huge investment throughout the country need in order to provide a laboratory network to register all sporadic and epidemic cases. This program will not be progress without the support of health system with cooperation of and research centers.
Therefore, in this paper, we tried to examine the features and limitations of the pulse field electrophoresis, and provide a functional model that would help the health system to provide the required warning. It is hoped that with the corrective comments of the dear scholars, there would be an appropriate system for achieving this goal.
کلیدواژه‌ها [English]
Molecular epidemiology, Entric Infections, Health System
مراجع

1-Mafi M, Hajia M, Goya MM. A five years study on the epidemiological approaches of Cholera in Iran.

 2-Bakhshi B, Ghafari M, Pourshafie MR, Zarbakhsh B, Katouli M, Hajia M, et al. Resistance-Gene Cassettes Associated With Salmonella enterica Genotypes. Lab Med. 2015;46(2):90–6.

 3-Hall RM, Collis CM. Antibiotic resistance in gram-negative bacteria: the role of gene cassettes and integrons. Drug Resist Updat. 1998;1:109-119.

4-Cooper KL, Luey CK, Bird M, Terajima J, Nair GB, Kam KM. Development and validation of a PulseNet standardized pulsed-field gel electrophoresis protocol forsubtyping of Vibrio cholerae. Foodborne Pathog Dis. 2006;3(1):51-58.

 5-Arakawa E, Murase T, Matsushita S, et al. Pulsed-field gel electrophoresis-based molecular comparison of Vibrio cholerae O1 isolates from domestic and imported cases of cholera in Japan. J Clin Microbiol. 2000;38:424-426.

 6-Cameron DN, Khambaty FM, Wachsmuth IK, Tauxe RV, Barrett TJ. Molecular characterization of Vibrio cholerae O1 strains by pulsed-field gel electrophoresis. Journal of clinical microbiology 1994;32:1685-90.

 7-Tsen H-Y, Lin JS, Hu HH, Liu PR, Wang TK. Use of pulsed field gel electrophoresis as an epidemiological tool for analysis of sporadic associated strains of Salmonella typhi isolated in Taiwan. J Appl Microbiol. 1999;86:761-768.

 8-Cooper KL, Luey CK, Bird M, Terajima J, Nair GB, Kam KM. Development and validation of a PulseNet standardized pfge protocol forsubtyping of Vibrio cholerae. Foodborne Pathog Dis. 2006;3(1):51-8.

 9-Dallal MM, Telefian CF, Hajia M, Identification and molecular epidemiology of nosocomial outbreaks due to Burkholderia cepacia in cystic fibrosis patients of Masih Daneshvary Hospital, Iran. J Prev Med Hyg. 2014;55(1):27-30.

 10-Eftekhari N, Bakhshi B, Pourshafie MR, Zarbakhsh B, Rahbar M, Hajia M. Genetic diversity of Shigella spp. and their integron content. Foodborne Pathog Dis. 2013;10(3):237-42.

 11-Hajia M, Rahbar M, Farzami MR, Asl HM, Dolatyar A, Imani M, Saburian. Assessing clonal correlation of epidemic Vibrio cholerae isolates during 2011 in 16 provinces of Iran. Curr Microbiol. 2015;70(3):408-14.

 12-Hajia M,  Dolatyar A,  Farzami MR, Imani M,  Saburian R.  Evaluating correlation of the native Inaba strain with the dominant isolated strains in outbreaks occurred in Iran at 2013 by Pulsed Field Gel Electrophoresis. Journal of Microbiology and Infectious Diseases. 2016; 6 (3): 184-189.

 13-Miranda AG, Singh KV, Murray BE. DNA fingerprinting of Enterococcus faecium by pulsed-field gel electrophoresis may be a useful epidemiologic tool. Journal of clinical microbiology. 1991;29:2752-7.

 14-Ribot EM, Fair MA, Gautom R. Standardization of pulsed-field gel electrophoresis protocols for the subtyping of Escherichia coliO157:H7, Salmonella, and Shigella for PulseNet. Foodborne Pathog Dis. 2006;3:59-67.

 15-Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, Mickelsen PA, Murray BE, Persing DH, Swaminathan B. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing. J Clin Microbiol. 1995;33(9):2233-9.

 16- Amiri M, Mohajeri P, Rezaei M. A New Method for Calculating Lane Average Width on the Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) Images for Lane Detection and Extraction Problem.  Journal of Isfahan Medical School . 2015;33(359):3rd Week, January 2016.

17-PulseNet Participants. https://www.cdc.gov/pulsenet/participants/index.html.

 18-PulseNet Middle East.  http://www.pulsenetinternational.org/networks/middleeast/

 19-Nsofor CA. Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE): Principles and Applications in Molecular Epidemiology: A Review.  Int. J. Curr. Res. Med. Sci. (2016). 2(2): 38-51.

 20-Bagheri M   GholiPour M ,   Shokoohizadeh L ,  Navab-Akbar FT.  Analysis of Clonal Relationships among Shigella spp. Isolated from Children with Shigellosis in Ahvaz, Iran. Journal of Paramedical Sciences. 2016; 7(2): 2008-4978.

 21-Prevalence and antimicrobial resistance of Salmonella isolated from rentail raw turkey, ostrich and partridge meat in Iran. Rahimi E, Ameri M, Kazemeini HR, Elbag M.  Bulgarian Journal of Veterinary Medicine.  2010;13(1):23−30.

 22-Khaghani S, Shamsizadeh A, Nikfar R, Hesami A. Shigella flexneri: a three-year antimicrobial resistance monitoring of isolates in a Children Hospital, Ahvaz, Iran. Iranian Journal of Microbiology. 2014; 6 (4):225-9.

 23-Havaei SA, Rezaei N, Havaei R, Ebrahimzadeh Namvar A. Detection of enterotoxins and genotyping of Staphylococcus aureus strains isolated from Isfahan Educational Hospital, Iran. Microbiologia Medica. 2017; 32:6965.

 24-Bakhshi B, Ghafari M, Pourshafie MR, Zarbakhsh B, Katouli M, Rahbar M, et al. Resistance-Gene Cassettes Associated With Salmonella enterica Genotypes. Lab Med. 2015;46(2):90–6.

 25- Zeinab Ahmadi Z, Ranjbar R,  Sarshar R. Genotyping of Salmonella Enterica Serovar Enteritidis Strains Isolated from Clinical Samples by Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE). Journal of Isfahan Medical School Received. 2013;31(240): 2nd Week, August 2013.

26- Pulsed field Gel electriohoresis. http://uvmgg.wikia.com/wiki/Pulsed_Field_Gel_Electrophoresis

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 1,625
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,508